Recerca en Patologia Oncològica i Bioinformàtica (PO&B)

GRUPS CLÍNICS
OBJECTIUS

El grup de recerca en Patologia Oncològica i Bioinformàtica (PO&B) constitueix una plataforma específica per activitats d’investigació centrades en càncer i en anàlisi d’imatges digitals i modelització matemàtica.

RESPONSABLES
  • Marylène Lejeune

  • Carlos López Pablo

  • Presentació
  • Línies
  • Membres del grup
  • Publicacions
  • Projectes
  • Ofertes laborals
  • Contactar

L’equip PO&B de l’IISPV, amb seu a l’Hospital de Tortosa Verge de la Cinta, treballa des de fa més de 15 anys en la prevenció i el diagnòstic avançat del càncer. Liderat per la Dra. Marylène Lejeune i el Dr. Carlos López, l’equip PO&B és un grup interdisciplinari que inclou patòlegs, oncòlegs, hematòlegs, biòlegs i especialistes en informàtica, amb habilitats clíniques i metodològiques estratègiques per al desenvolupament de les línies de recerca del grup. Durant tots aquests anys, el grup ha tingut diferents projectes finançats conjuntament amb col·laboradors nacionals (Universitat Rovira i Virgili [URV] de Tarragona; Universidad de Castilla-la Mancha; Hospital Universitario Puerta del Mar de Cadis; Universidad de Las Palmas de Gran Canaria) i internacionals (Nalecz Institute of Biocybernetics and Biomedical Engineering de Varsòvia, Polònia; Université de Caen, França).

Les línies de recerca consolidades de l’equip PO&B se centren en l’estudi del microambient tumoral mitjançant anàlisi d’imatges digitals i modelatge matemàtic. La resposta immune és un dels components del microambient tumoral que s’ha demostrat que exerceix un paper important en l’evolució de pacients amb càncer. Els canvis en el tipus i la quantitat de cèl·lules immunes al microambient tumoral han estat relacionats amb diferències en la funcionalitat de la malaltia. El nostre equip ha estudiat aquests canvis gràcies al desenvolupament de nous algoritmes d’anàlisi d’imatges assistides per ordinador capaços de proporcionar una quantificació automatitzada més precisa i reproduïble de biomarcadors immunes amb una tinció immunohistoquímica i de fluorescència.

El grup PO&B és reconegut com a grup URV des de 2016, com a grup emergent des de 2009 i consolidat des de 2014 per l’Agència de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR). Els membres de l’equip coordinen també la plataforma transversal i de suport de l’IISPV per a estudis histològics, patològics i de digitalització.

El grup treballa amb l’objectiu estratègic de millorar l’administració dels tractaments actuals en càncer i detectar noves dianes terapèutiques en càncer de mama i en limfomes per poder disminuir el risc de recaiguda i millorar la supervivència dels pacients. Les línies d’investigació del grup són les següents:

1) Estudi de patrons de biomarcadors del microambient tumoral. L’objectiu d’aquesta línia d’investigació és  identificar patrons de resposta immune del microambient tumoral i de factors etiològics, fisiopatogènics i pronòstics lligats a models de progressió de neoplàsies (càncer de mama i síndromes limfoproliferatius). Aquests objectius poden ajudar a entendre els mecanismes biològics implicats en la resistència a la quimioteràpia i l’obtenció de noves dianes terapèutiques amb capacitat d’intervenció, a més de la constitució de nous factors claus en el diagnòstic, pronòstic i tractament d’aquests pacients.

2) Morfometria i informàtica aplicada. L’objectiu d’aquest línia d’investigació és desenvolupar i perfeccionar nous suports informàtics d’anàlisi d’imatge assistit per ordinador per permetre una quantificació automatitzada més precisa i reproduïble de biomarcadors de cèl·lules tumorals i hoste del microambient tumoral amb tincions inmmunohistoquímiques i de fluorescència.

3) Recerca translacional en malalties hematològiques: avaluació de protocols diagnòstics i de tractaments. L’objectiu d’aquesta línia d’investigació és ampliar el coneixement previ existent de les malalties de la sang, de nous procediments idonis per al seu diagnòstic i, molt especialment, de nous tractaments que permetin la curació o almenys perllongar la vida de les persones que pateixen una malaltia hematològica sigui neoplàstica o no.

    Año

    Clustered nuclei splitting based on recurrent distance transform in digital pathology images.

    Autors: Lukasz Roszkowiak L, KorzynskaA, Pijanowska D, Bosch R, Lejeune M, Lopez C.

    Revista: EURASIP Journal on Image and Video Processing

    Any i pàgina: EURASIP Journal on Image and Video Processing volume 2020, Article number: 26 (2020)

    https://rd.springer.com/article/10.1186/s13640-020-00514-6

    Integrating the tumor microenvironment into cancer therapy.

    Autors: Sanegre S, Lucantoni F, Burgos-Panadero R, de La Cruz-Merino L, Noguera R, Álvaro Naranjo T.

    Revista: Cancers (Basel)

    Any i pàgina: 2020 Jun 24;12(6). pii: E1677. doi: 10.3390/cancers12061677

    Hyperspectral imaging and deep learning for the detection of breast cancer cells in digitized histological images

    Autors: Ortega S, Halicek M, Fabelo H, Guerra R, Lopez C, Lejaune M, Godtliebsen F, Callico GM, Fei B.

    Revista: Proc SPIE Int Soc Opt Eng

    Any i pàgina: 2020 Feb;11320. pii: 113200V. doi: 10.1117/12.2548609.

    An integral view of cancer (III). Evaluation of new biomarkers and treatment strategies

    Autors: Noguera R, Burgos-Panadero R, Lucantoni F, de la Cruz-Merino L, Álvaro Naranjo T.

    Revista: Rev Esp Patol

    Any i pàgina: 2020 Apr – Jun;53(2):88-99. doi: 10.1016/j.patol.2019.08.001. Epub 2019 Nov 22

    Conditional generative adversarial network for synthesizing hyperspectral images of breast cancer cells from digitized histology.

    Autors: Halicek M, Ortega S, Fabelo H, Lopez C, Lejaune M, Callico GM, Fei B.

    Revista: Proc SPIE Int Soc Opt Eng

    Any i pàgina: 2020 Feb;11320. pii: 113200U. doi: 10.1117/12.2549994.

     

    Application of a digital PCR method for WT1 to myeloid neoplasms in CR and deep ELN WT1 molecular response (<10 copies).

    Autors: Bussaglia E, Pratcorona M, Carricondo M, Sansegundo L, Rubio MA, Monter A, Brell A, Badell I, Esteve J, Arnan M, Talarn C, Tormo M, García A, Vall-Llovera F, Ortin X, Pedro C, Bargay J, Brunet S, Sierra J, Nomdedéu J.

    Revista: Ann Hematol

    Any i pàgina: 2020 Apr;99(4):765-772. doi: 10.1007/s00277-020-03910-0. Epub 2020 Feb 15.

    The immune response in non-metastatic axillary lymph nodes is associated with the presence of axillary metastasis and breast cancer patient outcome

    Autors: López C, Bosch R, Orero G, Korzynska A, García-Rojo M, Bueno G, Fernández-Carrobles MM, Gibert-Ramos A, Roszkowiak L, Callau C, Fontoura L, Salvadó MT, Álvaro T, Jaén J, Roso-Llorach A, Llobera M, Gil J, Onyos M,  Plancoulaine B,  Baucells J, Lejeune M.

    Revista: Am J Pathol

    Any i pàgina: 2019 Dec 19. pii: S0002-9440(19)30860-0. doi: 10.1016/j.ajpath.2019.11.002.

    Immune response profile of primary tumour, sentinel and non-sentinel axillary lymph nodes related to metastasis in breast cancer: An immunohistochemical point of view

    Autors: Gibert-Ramos A, López C, Bosch R, Fontoura L, Bueno G, García-Rojo M, Berenguer M, Lejeune M.

    Revista: Histochem Cell Biol

    Any i pàgina: 2019 Jul 13. doi: 10.1007/s00418-019-01802-7

    The Tumour microenvironment as an integrated framework to understand cancer biology

    Autors: Burgos-Panadero R, Lucantoni F, Gamero-Sandemetrio E, Cruz-Merino L, Naranjo TÁ, Noguera R.

    Revista: Cancer Lett

    Any i pàgina: 2019 Jul 17. pii: S0304-3835(19)30406-9. doi: 10.1016/j.canlet.2019.07.010

    An integral view of cancer (I). The study, classification and reprogramming of the tumoral microclimate

    Autors: Noguera R, Burgos-Panadero R, Gamero-Sandemetrio E, de la Cruz-Merino L, Álvaro Naranjo T.

    Revista: Rev Esp Patol

    Any i pàgina: 2019 Apr – Jun;52(2):92-102. doi: 10.1016/j.patol.2018.11.003. Epub 2019 Feb 10

    An integral view of cancer (II). Fields of investigation and emerging biomarkers

    Autors: Noguera R, Burgos-Panadero R, Gamero-Sandemetrio E, de la Cruz-Merino L, Álvaro Naranjo T.

    Revista: Rev Esp Patol

    Any i pàgina: 2019 Oct – Dec;52(4):222-233. doi: 10.1016/j.patol.2019.04.005. Epub 2019 Jun 11

    The medicine of cancer: Can the solutions be found in our own back yard?

    Autors: Naranjo T.

    Revista: Rev Esp Patol

    Any i pàgina: 2019 Apr – Jun;52(2):69-71. doi: 10.1016/j.patol.2018.10.004.

    The poor prognosis of low hypodiploidy in adults with B-cell precursor acute lymphoblastic leukaemia is restricted to older adults and elderly patients

    Autors: Ribera J, Granada I, Morgades M, Vives S, Genescà E, González C, Nomdedeu J, Escoda L, Montesinos P, Mercadal S, Coll R, González-Campos J, Abella E, Barba P, Bermúdez A, Gil C, Tormo M, Pedreño M, Martínez-Carballeira D, Hernández-Rivas JM, Orfao A, Martínez-López J, Esteve J, Bravo P, Garcia-Guiñon A, Debén G, Moraleda JM, Quiezán JA, Ortín X, Moreno MJ, Feliu E, Solé F, Ribera JM; PETHEMA Group, Spanish Society of Haematology.

    Revista: Br J Haematol

    Any i pàgina: 2019 Jul;186(2):263-268. doi: 10.1111/bjh.15887.

    Prediction of early mortality in patients with cancer-associated thrombosis in the RIETE database

    Autors: Fuentes HE, Tafur AJ, Caprini JA, Alatri A, Trujillo-Santos J, Farge-Bancel D, Rosa V, Font L, Vilaseca A, Monreal M; RIETE Investigators.

    Revista: Int Angiol

    Any i pàgina: 2019 Jun;38(3):173-184. doi: 10.23736/S0392-9590.19.04110-5

    Gestational diabetes impacts fetal precursor cell responses with potential consequences for offspring

    Autors: Algaba-Chueca F, Maymó-Masip E, Ejarque M, Ballesteros M, Llauradó G, López C, Guarque A, Serena C, Martínez-Guasch L, Gutiérrez C, Bosch R, Vendrell J, Megía A, Fernández-Veledo S.

    Revista: Stem Cells Transl Med

    Any i pàgina: 2019 Dec 27. doi: 10.1002/sctm.19-0242

    Ten-year follow-up of clinical governance implementation in primary care: Improving screening, diagnosis and control of cardiovascular risk factors

    Autors: Aguilar Martín C, Gonçalves AQ, López-Pablo C, Fernández-Sáez J, Forcadell Drago E, Hernández Rojas Z, Pepió Vilaubí JM, Rodríguez Cumplido D, Piñol JL, Bladé-Creixenti J, Dalmau Llorca MR

    Revista: Int J Environ Res Public Health

    Any i pàgina: 2019 Nov 5;16(21). pii: E4299. doi: 10.3390/ijerph16214299

  • Title: R-GDP with Lenalidomide (R2-GDP) in patients with relapsed or refractory diffuse large B cell lymphoma (r/r DLBCL) not suitable for high dose therapy and stem-cell transplantation.

    Funding entity: Celgene

    Duration: 2014-2019

    Principal Investigator: Luis de la Cruz Merino (GOTEL)

    Collaborationg investigators: T. Álvaro MD, PhD – M. Lejeune BSc, PhD

  • Title: Incidencia de carcinoma in situ y cáncer de cérvix específica por genotipo del virus del papiloma humano (VPH) en las provincias de Girona y de Tarragona.

    Funding entity: ICO

    Duration: 2014-2018

    Principal Investigator: Silvia de Sanjosé Llongueras

    Collaborationg investigators: R. Bosch MD.

  • Title: Análisis automatizado de biomarcadores del microambiente tumoral en cáncer de mama triple negativo sin respuesta patológica completa a la neoadyuvancia. Factores predictivos de recaída (PI13/02501).

    Funding entity: Instituto de Salud Carlos III

    Duration: 2014-06/2017

    Principal Investigator: M. Lejeune BSc, PhD.

  • Title: Desarrollo de metodologías automatizadas para establecer patrones de respuesta inmune mediante la cuantificación de marcadores inmunohistoquímicos en cáncer de mama (PI11/00488).

    Funding entity: Instituto de Salud Carlos III

    Duration: 2012-2014

    Principal Investigator: C. López BSc, PhD.

Membres De L’equip

  • Responsable de grup, PhD

    • Marylène Lejeune
    • Carlos López Pablo
  • Investigador clínic

    • Ramon Bosch Príncep
    • Teresa Salvadó Usach
    • Tomàs Alvaro Naranjo
    • Montserrat Llobera Serentill
    • Xavier Ortín Font
    • Marta Rodríguez Luaces
    • Llorenç Font Ferré
  • Investigador Post-doctoral

    • Jordi Baucells Lluís
    • Bàrbara Tomàs Arasa
    • Vanessa Gestí García
    • Anna Curto Subirats
    • Noelia Burgués Llaó
    • Anna Suñé Martín
    • Eduard Nolla Villalonga
    • Almudena Nàgera Porres
    • Maria del Mar Barberà Marro
    • Beatriu Domènech Grau
    • Marc Iniesta Valldepérez
    • Maria Cinta Curto Anoll
    • Ana Guasch Bosch
    • Monsterrat Salvado Piñol
  • Tècnics de recerca i informàtica

    • Jordi Baucells Lluís
    • Esther Sauras Colon
    • Júlia Casanova Ribes
    • Andrea Gras Navarro
  • Col·laboradors externs

    • Anna Korzynska
    • Benoît Plancoulaine
    • Nicolas Elie
    • Gloria Bueno
    • Domènec Puig Valls
    • Marcial García-Rojo
    • Gustavo Marrero Callico