Quimioinformàtica i nutrició (QiN)

INFECCIÓ, IMMUNITAT I MEDI AMBIENT
OBJECTIUS

El grup de recerca en Quimioinformàtica i Nutrició té com a principal objectiu de les seves investigacions la identificació de molècules bioactives en bases de dades moleculars que puguin ser utilitzades en el desenvolupament tant d’aplicacions mèdiques (tractament de diabetis mellitus, inflamació crònica, antivirals, anticancerígens, etc.) com de cosmètica molecular (tractament del fotoenvelliment, despigmentació cutània, autobronzejadors, etc.) o alimentació funcional (prevenció de diabetis mellitus i inflamació crònica). Per tal d’aconseguir aquests objectius utilitzem eines computacionals tant de creació pròpia com aliena.

RESPONSABLES
  • Santiago García-Vallvé

  • Presentació
  • Línies de recerca
  • Membres
  • Projectes competitius
  • Projectes no competitius
  • Publicacions
  • Tesis doctorals
  • Innovació i transferència

El grup de recerca Quimioinformàtica i Nutrició (QiN) utilitza eines computacionals per identificar molècules bioactives amb aplicacions mèdiques, cosmètiques i nutricionals. Les seves línies principals inclouen la cerca d’antivirals (SARS-CoV-2, Dengue, Zika), anticancerígens (per a càncer de cap i coll) i fàrmacs per a l’Alzheimer , sovint en col·laboració amb altres grups científics.

També treballa en el desenvolupament de productes despigmentants naturals , pèptids bioactius i inhibidors d’enzims com la proteasa del SARS-CoV-2. El grup ha participat en múltiples projectes competitius i contractes de transferència tecnològica amb empreses com Bella Aurora S.A. i Eurecat. A més, han publicat nombrosos articles en revistes d’alt impacte i han contribuït al disseny de patents amb aplicació industrial i terapèutica.

  • Cerca d’antivirals contra el SARS-CoV-2, el Dengue i el Zika.
  • Cerca d’anticancerígens en càncer de coll i cap (projecte que es fa en col·laboració amb el grup de recerca “Head and neck cancer: Biomedical Research in Tumor Stem Cells” del VHRI i el “Medicinal Chemistry & Synthesis” del CSIC).
  • Cerca de fàrmacs pel tractament de l’Alzheimer (en col·laboració amb el grups de recerca de la Dra. Cristina Malagelada i en “Medicinal Chemistry and Pharmacology of Neurodegenerative diseases” de la UB).

    Dels últims cinc anys

  • Títol: Desarrollo de nuevas herramientas computacionales para el descubrimiento de fármacos contra las pandemias actuales y futuras (NEXT-PANDEMICS)

    Investigador/a principal: Santiago Garcia Vallvé i Francesc d’Assís Serratosa Casanelles

    Investigadors/es col·laboradors/es: Gerard Pujadas Anguiano, Maria Carmen Julià Ferré, Susana Maria Alvarez Fernandez

    Codi expedient: PID2022-138327OB-I00

    Import: 45.000€

    Data inici: 01/09/2023

    Data fi: 31/08/2026

    Organisme finançador: MINISTERIO DE CIENCIA Y INNOVACION

  • Títol: Quimioinformàtica i Nutrició

    Investigador/a principal: Gerard Pujadas Anguiano

    Investigadors/es col·laboradors/es: Santiago Garcia Vallvé, Pere Puigbò Avalos, Bryan Percy Saldivar Espinoza i Guillem Macip Sancho

    Codi expedient: 2021 SGR 00031

    Import: 0€

    Data inici: 01/01/2022

    Data fi: 30/06/2025

    Organisme finançador: AGENCIA DE GESTIO D’AJUTS UNIVERSITARIS

  • Títol: Aproximació tècnica integrada pel descobriment de nous compostos bioactius amb propietats beneficioses per la salut cutània.

    Investigador/a principal: Miquel Mulero Abellán

    Investigadors/es col·laboradors/es: Gerard Pujadas Anguiano, Santiago Garcia Vallvé, Begoña Muguerza

    Codi expedient: R2B2023/06

    Import: 10.000 €

    Data inici: 12/04/2023

    Data fi: 31/12/2023

    Organisme finançador: Fundació URV

  • Títol: PEPTIDEGO: Una plataforma bioinformàtica per la valorització i el guiatge en l’obtenció en condicions industrials de pèptids bioactius procedents de subproductes i excedents de la indústria agroalimentària.

    Investigador/a principal: Gerard Pujadas Anguiano

    Investigadors/es col·laboradors/es: Santiago Garcia Vallvé, Adrià Cereto-Massagué

    Codi expedient: R2B2022/06

    Import: 10.000 €

    Data inici: 12/04/2022

    Data fi: 31/12/2022

    Organisme finançador: Fundació URV

    Dels últims cinc anys

  • Títol: ESTUDIO BIOCOMPUTACIONAL PARA IDENTIFICAR LAS DIANAS MOLECULARES DEL EFECTO ANTIMICROBIANO DE LOS PRODUCTOS DE OHWHITE

    Investigador/a principal: Gerard Pujadas

    Investigadors/es col·laboradors/es: Santi Garcia-Vallvé, Aleix Gimeno Vives

    Tipus de projecte: Contracte de transferència

    Import: 15.000,00€

    Data inici: 14/01/2025

    Data fi: 31/12/2025

    Entitat/Empresa finançadora: Fundació Eurecat

  • Títol: ESTUDIO IN SILICO PARA OPTIMIZAR LA UTILIZACION DEL PRODUCTO SANIDERMIX

    Investigador/a principal: Gerard Pujadas

    Investigadors/es col·laboradors/es: Santi Garcia-Vallvé, Aleix Gimeno Vives

    Tipus de projecte: Contracte de transferència

    Import: 15.000,00€

    Data inici: 25/10/2024

    Data fi: 24/10/2025

    Entitat/Empresa finançadora: Fundació Eurecat

  • Títol: DESENVOLUPAMENT I MILLORA DE LA PLATAFORMA BIOINFORMATICA PEPTIDEGO

    Investigador/a principal: Gerard Pujadas

    Investigadors/es col·laboradors/es: Santi Garcia-Vallvé, Adrià Cereto-Massagué

    Tipus de projecte: Contracte de transferència

    Import: 4.500,00€

    Data inici: 04/04/2022

    Data fi: 03/06/2022

    Entitat/Empresa finançadora: Fundació Eurecat

  • Títol: DISEÑO Y DESARROLLO DE UN NOVEDOSO PRODUCTO DESPIGMENTANTE A PARTIR DE INGREDIENTES NATURALES QUE ATACA NUEVAS Y MÚLTIPLES DIANAS

    Investigador/a principal: Gerard Pujadas

    Investigadors/es col·laboradors/es: Santi Garcia-Vallvé

    Tipus de projecte: Contracte de transferència

    Import: 40.000,00€

    Data inici: 01/01/2021

    Data fi: 31/03/2022

    Entitat/Empresa finançadora: Bella Aurora S.A.

    Articles publicats en revistes indexades, incloent el FI i quartil, últims 5 anys

  • Títol: SARS-CoV-2 main protease (M-pro) mutational profiling: An insight into mutation coldspots

    Autors/es:

    Pol Garcia-Segura, Ariadna Llop-Peiró, Nil Novau-Ferré, Júlia Mestres-Truyol, Bryan Saldivar-Espinoza, Gerard Pujadas, Santiago Garcia-Vallvé

    Títol revista: Computers in Biology and Medicine

    Any publicació: 2025

    Vòlum, pagines: 184:109344

    FI: 7.0

    Quartil: Q1 Biology

  • Títol: Are protein-ligand docking programs good enough to predict experimental poses of noncovalent ligands bound to the SARS-CoV-2 main protease?

    Autors/es: Ariadna Llop-Peiró, Guillem Macip, Santiago Garcia-Vallvé, Gerard Pujadas

    Títol revista: Drug Discov Today

    Any publicació: 2024

    Vòlum, pagines: 29(10):104137

    FI: 6.5

    Quartil: Q1 PHARMACOLOGY & PHARMACY

  • Títol: Ligand- and Structure-Based Virtual Screening Identifies New Inhibitors of the Interaction of the SARS-CoV-2 Spike Protein with the ACE2 Host Receptor

    Autors/es: Timoteo Delgado-Maldonado, Alonzo González-González, Adriana Moreno-Rodríguez, Virgilio Bocanegra-García, Ana Verónica Martinez-Vazquez, Erick de Jesús de Luna-Santillana, Gerard Pujadas, Guadalupe Rojas-Verde, Edgar E Lara-Ramírez, Gildardo Rivera

  • Títol revista: Pharmaceutics

    Any publicació: 2024

    Vòlum, pagines: 16(5):613

    FI: 4.9

    Quartil: Q1 PHARMACOLOGY & PHARMACY

  • Títol: Challenges in distinguishing functional proteins from polyproteins in databases: implications for drug discovery

    Autors/es: Ariadna Llop-Peiró, Gerard Pujadas, Santiago Garcia-Vallvé

    Títol revista: Briefings in Bioinformatics

    Any publicació: 2024

    Vòlum, pagines: 25(2):bbae012

    FI: 6.8

    Quartil: Q1 BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS

  •  

    Títol: Identification of N-Acyl Hydrazones as New Non-Zinc-Binding MMP-13 Inhibitors by Structure-Based Virtual Screening Studies and Chemical Optimization

    Autors/es: Doretta Cuffaro, Aleix Gimeno, Bianca Laura Bernardoni, Riccardo Di Leo, Gerard Pujadas, Santiago Garcia-Vallvé, Susanna Nencetti, Armando Rossello, Elisa Nuti

    Títol revista: International Journal Of Molecular Sciences

    Any publicació: 2023

    Vòlum, pagines: 24(13):11098

    FI: 5.6

    Quartil: Q1 BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY

  • Títol: The Mutational Landscape of SARS-CoV-2

    Autors/es: Bryan Saldivar-Espinoza, Pol Garcia-Segura, Nil Novau-Ferré, Guillem Macip, Rubén Martínez, Pere Puigbò, Adrià Cereto-Massagué, Gerard Pujadas, Santiago Garcia-Vallvé

    Títol revista: International Journal Of Molecular Sciences

    Any publicació: 2023

    Vòlum, pagines: 24(10):9072

    FI: 5.6

    Quartil: Q1 BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY

  • Títol: Drug Potency Prediction of SARS-CoV-2 Main Protease Inhibitors Based on a Graph Generative Model

    Autors/es: Sarah Fadlallah , Carme Julià, Santiago García-Vallvé, Gerard Pujadas, Francesc Serratosa

    Títol revista: International Journal Of Molecular Sciences

    Any publicació: 2023

    Vòlum, pagines: 24(10):8779

    FI: 5.6

    Quartil: Q1 BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY

  • Títol: Recent advances in the development of methyltransferase (MTase) inhibitors against (re)emerging arboviruses diseases dengue and Zika

    Autors/es: Delgado-Maldonado T; Moreno-Herrera A; Pujadas G; Vázquez-Jiménez LK; González-González A; Rivera G

    Títol revista: European Journal Of Medicinal Chemistry

    Any publicació: 2023

    Vòlum, pagines: 252 115290-

    FI: 7.088

    Quartil: Q1 Chemistry, Medicinal

  • Títol: Prediction of Recurrent Mutations in SARS-CoV-2 Using Artificial Neural Networks

    Autors/es: Saldivar-Espinoza, Bryan; Macip, Guillem; Garcia-Segura, Pol; Mestres-Truyol, Julia; Puigbo, Pere; Cereto-Massague, Adria; Pujadas, Gerard; Garcia-Vallve, Santiago

    Títol revista: International Journal Of Molecular Sciences

    Any publicació: 2022

    Vòlum, pagines: 23(23):14683.

    FI: 6.208.

    Quartil: Q1 Chemistry, Multidisciplinary.

  • Títol: A review of the current landscape of SARS-CoV-2 main protease inhibitors: Have we hit the bullseye yet?

    Autors/es: Macip G; Garcia-segura P; Mestres-truyol J; Saldivar-espinoza B; Pujadas G; Garcia-Vallvé S

    Títol revista: International Journal Of Molecular Sciences

    Any publicació: 2022

    Vòlum, pagines: 23(1):259

    FI: 6.208.

    Quartil: Q1 Chemistry, Multidisciplinary.

  • Títol: Haste makes waste: A critical review of docking-based virtual screening in drug repurposing for SARS-CoV-2 main protease (M-pro) inhibition

    Autors/es: Macip, Guillem; Garcia-Segura, Pol; Mestres-Truyol, Julia; Saldivar-Espinoza, Bryan; Ojeda-Montes, Maria Jose; Gimeno, Aleix; Cereto-Massague, Adria; Garcia-Vallve, Santiago; Pujadas, Gerard

    Títol revista: Medicinal Research Reviews

    Any publicació: 2022

    Vòlum, pagines: 42(2):744-769

    FI: 12.388

    Quartil: Q1 Pharmacology & Pharmacy

  • Títol: Identification of Broad-Spectrum MMP Inhibitors by Virtual Screening

    Autors/es: Gimeno, Aleix; Cuffaro, Doretta; Nuti, Elisa; Ojeda-Montes, Maria Jose; Beltran-Debon, Raul; Mulero, Miquel; Rossello, Armando; Pujadas, Gerard; Garcia-Vallvé

    Títol revista: Molecules

    Any publicació: 2021

    Vòlum, pagines: 26(15):4553

    FI: 4.927

    Quartil: Q2 Chemistry, Multidisciplinary

  • Títol: Anti‐inflammatory and immunomodulatory effects of the grifola frondosa natural compound o‐orsellinaldehyde on lps‐challenged murine primary glial cells. Roles of NF‐κβ and MAPK

    Autors/es: Tomas‐hernandez S; Blanco J; Garcia‐Vallvé S; Pujadas G; Ojeda‐montes MJ; Gimeno A; Arola L; Minghetti L; Beltrán‐debón R; Mulero M

    Títol revista: Pharmaceutics

    Any publicació: 2021

    Vòlum, pagines: 13(6):806

    FI: 6.525

    Quartil: Q1 Pharmacology & Pharmacy

  • Títol: Prediction of Novel Inhibitors of the Main Protease (M-pro) of SARS-CoV-2 through Consensus Docking and Drug Reposition

    Autors/es: Gimeno A; Mestres-Truyol J; Ojeda-Montes MJ; Macip G; Saldivar-Espinoza B; Cereto-Massagué A; Pujadas G; Garcia-Vallvé S

    Títol revista: International Journal Of Molecular Sciences

    Any publicació: 2020

    Vòlum, pagines: 21(11):3793

    FI: 5.924

    Quartil: Q1 Biochemistry & Molecular Biology

  • Títol: Understanding the variability of the S1′ pocket to improve matrix metalloproteinase inhibitor selectivity profiles

    Autors/es: Gimeno A, Beltrán-Debón R, Mulero M, Pujadas G, Garcia-Vallvé S

    Títol revista: Drug Discovery Today

    Any publicació: 2020

    Vòlum, pagines: 25(1):38-57

    FI: 7.851

    Quartil: Q1 Pharmacology & Pharmacy

  • Títol: DISEÑO Y DESARROLLO DE UN NOVEDOSO PRODUCTO DESPIGMENTANTE A PARTIR DE INGREDIENTES NATURALES QUE ATACA NUEVAS Y MÚLTIPLES DIANAS

    Nom doctorand: TIMOTEO DELGADO MALDONADO

    Any defensa: 2025

    Universitat: INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL (REYNOSA, MÉXICO)

  • Títol: Application of machine learning methods on SARS-Cov-2:

    Mortality prediction by using health and nutritional

    factors and prediction of recurrent mutations

    Nom doctorand: Bryan Percy Saldivar Espinoza

    Any defensa: 2024

    Universitat: Universitat Rovira i Virgili

  • Títol: Studying the limits of protein-ligand docking to predict new non-covalent inhibitors for the SARSCoV-2 main protease

    Nom doctorand: Guillem Macip Sancho

    Any defensa: 2023

    Universitat: Universitat Rovira i Virgili

  • Títol: Identification of protein tyrosine phosphatase 1B

    and matrix metalloproteinase 13 inhibitors by

    virtual screening for the treatment of obesity and

    obesity-associated disorders

    Nom doctorand: Aleix Gimeno Vives

    Any defensa:2019

    Universitat: Universitat Rovira i Virgili

  • Títol: COMPOUNDS FOR USE IN THE TREATMENT OF CANCERS THAT OVEREXPRESS TSPAN1

    Sol.licitant:  FUNDACIÓ HOSPITAL UNIVERSITARI VALL D’HEBRON – INSTITUT DE RECERCA

    UNIVERSITAT ROVIRA I VIRGILI

    CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTÍFICAS (CSIC)

    Nº sol.licitud: EP23383269.0

    Data de sol.licitud: 11 de diciembre de 2023

    Oficina de dipòst: Spanish Patent and Trademark Office (OEPM)

Membres De L’equip

  • Responsable de grup

    • Santiago García-Vallvé
  • Equip de recerca

    • Aleix Gimeno Vives
    • Ariadna Llop Peiró
    • Gerard Pujadas Anguiano