Desenvolupen una metodologia que millora la identificació i descripció de marcadors biomèdics
MÉS INFORMACIÓ
Desenvolupen una metodologia que millora la identificació i descripció de marcadors biomèdics
Un equip investigador de la Plataforma Metabolòmica URV-IISPV-CIBERDEM patenta aquesta tècnica, que obre les portes a la descripció del conjunt del metaboloma humà.
Foto de l’equip investigador que ha participat en l’estudi. D’esquerra a dreta: Roger Giné, Òscar Yanes, Maria Vinaixa, Josep M. Badia y Jordi Capellades.
La metabolòmica és una tecnologia del camp de les ciències òmiques que estudia els metabòlits, petites molècules presents a la sang i als teixits que reflecteixen l’activitat i l’estat metabòlic de l’organisme. Alguns poden ser determinants a l’hora d’indicar el risc, l’aparició o el curs que tindrà una malaltia en concret: se’ls coneix com a marcadors. Però trobar un marcador entre milers de metabòlits no és una tasca senzilla. Les estratègies d’anàlisi actuals basades en l’espectrometria de masses són capaces de detectar centenars i fins i tot milers de metabòlits, però identificar-ne l’estructura química és un repte encara per resoldre. Ara un equip investigador de la Universitat Rovira i Virgili, l’Institut d’Investigació Sanitària Pere Virgili (IISPV) i el CIBERDEM ha desenvolupat una metodologia que millora significativament la capacitat d’identificar i descriure aquests marcadors. Els resultats de la recerca s’han publicat a la revista científica Nature Methods.
L’espectrometria de masses aporta dades espectrals sobre la presència de metabòlits en mostres d’interès biomèdic. Amb aquesta metodologia l’equip investigador ha aconseguit aprofitar la informació química que es troba a les bases de dades del metaboloma humà per projectar-la de manera massiva sobre les dades i senyals espectrals i d’aquesta manera desxifrar quins senyals contenen informació biològica rellevant. Així, han demostrat que una gran majoria dels senyals de la mostra analitzada són redundants o inespecífics i han millorat substancialment la capacitat d‘identificar i descriure els metabòlits.
“Si ens imaginem un local on hi ha centenars de persones parlant, amb les tècniques actuals podríem veure que hi ha molta gent que dialoga entre si, però seria molt difícil desxifrar el contingut d’una sola conversa. La tècnica que hem desenvolupat ens permet identificar molt més ràpidament les converses que ens interessen i el contingut”, explica a mode d’exemple l’investigador Òscar Yanes, del Departament d’Enginyeria Electrònica, Elèctrica i Automàtica i de la Plataforma Metabolòmica URV-IISPV-CIBERDEM.
Concretament, l’equip investigador ha aconseguit filtrar fins a un 90% de senyals inespecífics, i augmentar fins a quatre vegades la capacitat per identificar i descriure marcadors i conèixer-ne l’estructura química. Això suposa un pas important a l’hora de desxifrar el metaboloma humà, que és el conjunt de metabòlits involucrats en el metabolisme d’una cèl·lula, teixit o òrgan.
Aquest avenç també representa una millora en moltes aplicacions tecnològiques, sobretot en el camp de la recerca biomèdica, ja que permet identificar marcadors amb més facilitat del que s’havia aconseguit fins ara. La tecnologia desenvolupada per aquest equip investigador, que fa recerca al grup Metabolomics INterdisciplinary Laboratory (MIL@b) —reconegut per la Generalitat de Catalunya— s’ha protegit mitjançant una patent gràcies a la col·laboració amb la Unitat de Valorització de la FURV, per tal de portar-la al mercat.
Referència bibliogràfica: HERMES: a molecular formula-oriented method to target the metabolome. Roger Giné, Jordi Capellades, Josep M. Badia, Dennis Vughs, Michaela Schwaiger-Haber, Maria Vinaixa, Andrea M. Brunner, Gary J. Patti, Oscar Yanes. Doi: https://doi.org/10.1101/2021.03.08.434466
Utilitzem cookies al nostre lloc web per oferir-vos l’experiència més rellevant recordant les vostres preferències i repetint visites. En fer clic a "Accepta-ho tot", accepteu l'ús de TOTES les cookies. No obstant això, podeu visitar "Configuració de cookies" per proporcionar un consentiment controlat.
This website uses cookies to improve your experience while you navigate through the website. Out of these, the cookies that are categorized as necessary are stored on your browser as they are essential for the working of basic functionalities of the website. We also use third-party cookies that help us analyze and understand how you use this website. These cookies will be stored in your browser only with your consent. You also have the option to opt-out of these cookies. But opting out of some of these cookies may affect your browsing experience.
Necessary cookies are absolutely essential for the website to function properly. These cookies ensure basic functionalities and security features of the website, anonymously.
Galeta
Durada
Descripció
cookielawinfo-checkbox-analytics
11 months
This cookie is set by GDPR Cookie Consent plugin. The cookie is used to store the user consent for the cookies in the category "Analytics".
cookielawinfo-checkbox-functional
11 months
The cookie is set by GDPR cookie consent to record the user consent for the cookies in the category "Functional".
cookielawinfo-checkbox-necessary
11 months
This cookie is set by GDPR Cookie Consent plugin. The cookies is used to store the user consent for the cookies in the category "Necessary".
cookielawinfo-checkbox-others
11 months
This cookie is set by GDPR Cookie Consent plugin. The cookie is used to store the user consent for the cookies in the category "Other.
cookielawinfo-checkbox-performance
11 months
This cookie is set by GDPR Cookie Consent plugin. The cookie is used to store the user consent for the cookies in the category "Performance".
viewed_cookie_policy
11 months
The cookie is set by the GDPR Cookie Consent plugin and is used to store whether or not user has consented to the use of cookies. It does not store any personal data.
Functional cookies help to perform certain functionalities like sharing the content of the website on social media platforms, collect feedbacks, and other third-party features.
Performance cookies are used to understand and analyze the key performance indexes of the website which helps in delivering a better user experience for the visitors.
Analytical cookies are used to understand how visitors interact with the website. These cookies help provide information on metrics the number of visitors, bounce rate, traffic source, etc.
Advertisement cookies are used to provide visitors with relevant ads and marketing campaigns. These cookies track visitors across websites and collect information to provide customized ads.