16 de junio, 2021 | 12:00 – 14:00 | Es necesaria inscripción gratuita
American Society for Biochemistry and Molecular Biology
La primera parte de este taller de bioinformática proporcionará un tutorial para utilizar el portal web de vía/genoma de BioCyc y el software Pathway Tools desarrollado por el Grupo de Investigación de Bioinformática de SRI International.
BioCyc contiene genomas y reconstrucciones metabólicas de unos 18.000 organismos (bacterias, levaduras, ratones, moscas y humanos), así como herramientas para el análisis de datos ómicos. Los usuarios pueden pintar datos ómicos en diagramas de vías y diagramas de redes metabólicas ampliables, realizar análisis de enriquecimiento y, utilizando Omics Dashboard, obtener una vista visual integradora de los niveles de activación de diferentes sistemas celulares. El software Pathway Tools permite a los científicos crear reconstrucciones metabólicas y modelos metabólicos cuantitativos para genomas secuenciados en sus laboratorios o en otros lugares.
En la segunda parte del taller, Jeremy Zucker del Laboratorio Nacional del Noroeste del Pacífico dará una charla sobre reconstrucciones metabólicas basadas en Pathway Tools. Se titula «Investigaciones metabólicas y regulatorias asistidas por IA del reloj circadiano en el hongo filamentoso Neurospora crassa».
Ponientes
Peter Karp (SRI Internacional)
Suzanne Paley (SRI Internacional)
Jeremy Zucker (Laboratorio Nacional del Noroeste del Pacífico)
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