Metabolómica
La Plataforma Metabolómica es una unidad de investigación en metabolómica creada conjuntamente por la Universidad Rovira i Virgili (URV) y el Centro de Investigación Biomédica en Red de Diabetes y Enfermedades Metabólicas Asociadas (Ciberdem).
La metabolómica permite obtener una huella metabólica de una muestra biológica compleja. Utiliza técnicas analíticas complementarias con detectores que dan respuesta a un amplio espectro de metabolitos como la espectrometría de masas y la resonancia magnética nuclear. Con estas plataformas analíticas se puede obtener una medida no dirigida y semicuantitativa de los metabolitos presentes en matrices biológicas como el suero, la orina, tejidos y / o cultivos. La metabolómica tiene como objetivo recoger la máxima información en torno a estas matrices con la mínima manipulación de muestra. Una vez adquiridas las medidas, se obtiene un cúmulo de datos de los que empleando técnicas estadísticas multivariantes se obtiene la información bioquímica relevante. De esta forma se determina el perfil metabólico de un estado o patología en concreto. Esta información puede utilizarse a posteriori para el estudio de las causas de esta patología y establecer nuevos biomarcadores y / o dianas terapéuticas. Existen diferentes campos de aplicación de la metabolómica como el estudio a nivel metabólico de intervenciones nutricionales, el fenotipatge de modelos animales que se hayan modificado genéticamente; el estudio de cultivos celulares en respuesta a diferentes estímulos o estudios de fluxómica mediante marcaje isotópico, entre otros.
La Plataforma Metabolómica proporciona servicios de máxima calidad para llevar a cabo una investigación de referencia en metabolómica. Se garantiza el apoyo y asesoramiento de un especialista en todas las fases del proyecto a desarrollar (desde el diseño de experimentos hasta el tratamiento de muestra, el análisis de datos y la transformación de dichos datos en información bioquímicamente relevante).
Servicios:
- NMR Resonancia Magnética Nuclear de Alta Resolución
Elección de experimentos y núcleos más convenientes para el estudio: 1H con supresión de agua, CPMG (filtro bajos pesos moleculares), difusión (filtro altos pesos moleculares), espectroscopia 2D, estudios de 13C con marcado isotópico etc.
- Cromatografía (GC y HPLC) - Espectrometría Masas
Preparación y análisis tanto en GC MS como en LC-MS de muestras de biofluidos y / o extractos de tejidos.
- Tratamiento de datos
Uso de algoritmos de tratamiento de datos multivariantes, visualización multidimensional (PCA, PLS, PLS-DA ...) análisis de resultados.
Identificación / cuantificación metabolitos con variaciones más relevantes. Tratamientos estadísticos de los datos derivados de esta identificación.
Unión y comparación de datos de diferentes-ómicas ( "data mining") en una aproximación ligada a la biología de sistemas.
Contacto:
Metabolomics Platform
Campus Sescelades, SRCiT
Universitat Rovira i Virgili
Avda. Països Catalans, 26
43007 - Tarragona
Tel. 977 256 587 Fax 977 558 261
metabolomicsplatform@urv.cat
